Восемнадцатилетний Ринтаро Окабе не только учится в Токийском институте электротехники, но и является безумным ученым и создателем Лаборатории гаджетов будущего. В течение некоторого времени он проводил исследования, пытаясь изменить будущее, но потерпел неудачу. После этого он забросил свои научные изыскания, отделился от науки и решил вести жизнь обычного студента, пытаясь игнорировать неприятные воспоминания. Тем не менее, однажды он случайно встретил нейробиолога Махо Хияджо: несмотря на свое миниатюрное телосложение, из-за которого она выглядит слишком юной, эта девушка - очень амбициозный и опытный ученый.
Она рассказала, что в лаборатории уже приступили к созданию специального устройства, которое может сохранять воспоминания умершего человека и использовать их для возвращения его личности со всеми характерными чертами. Это изобретение может помочь в восстановлении личности покойной Курису Макисе, которая была спутницей Махо и коллегой Ринтаро, в смерти которой он до сих пор чувствует себя виноватым. Неудивительно, что мужчина быстро включился в проект, который вновь всколыхнул его жизнь.